apTabs:apTabs是一个采用Prototype框架开发的HTML/JavaScript Tab控件。支持Tab横向滚动隐藏，以便在一个比较狭窄的空间中显示更多的Tab标签页。支持通过Ajax，iFrame加载内容。支持IE6-7、IE8 beta2、Opera9、Chrome0.3、Safari3.1 Win和Firefox2-3等浏览器。

Prototype Carousel:基于Prototype和Script.aculo.us框架开发的图片幻灯切换程序，带左右滑动，并有滑动特效。

ProtoForm:基于Prototype框架开发，提供Form校验与Ajax提交功能。能够校验输入框中否必填，校验Email，日期，电话号码和URL等格式是否正确。利用Ajax发送数据，显示请求响应，加亮获取焦点的输入框等。

Lightbox2:Lightbox2基于Prototype和Scriptaculous开发，易于使用的Lightbox控件。

Modalbox:ModalBox用于生成Web2.0风格的模式对话框。基于Prototype+script.aculo.us框架开发，效果类似Mac OSX的模式对话框。内容可以通过Ajax加载或普通的HTML页面。

Showcase:Showcase是Prototype的一个扩展，能够以CoverFlow效果展示一整组图片。展示方向可以是：水平、垂直或倾斜。

LightWindow:LightWindow是一个基于Prototype & script.aculo.us构建，可灵活设置，支持显示任何内容的Lightbox效果控件（模式对话框）。支持的显示内容类型，包括Flash, Quicktime, Youtube视频或者是一个外部网页。另外，LightWindow还支持Gallery功能。可定制模式窗口的位置和自动调整大小以适合内容。

JavaScript Jabber Messenger:这是一个开源的JavaScript Jabber Messenger，采用Ext2.0与Prototype开发。

prototype.js开发者手册:prototype.js开发者手册（中文文档）。

Proto!TextboxList:一个使用Prototype library开发具有autocomplete功能类似于Facebook的TextboxList控件。